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【实验资料】荧光原位杂交技术(FISH)

16 人阅读发布时间:2024-01-08 16:31

荧光原位杂交技术(FISH)

简介:

       荧光原位杂交(FISH)技术是核酸分子杂交的一种先进方法。通过将已知的荧光标记的单链核酸作为探针,根据碱基互补的原理,经历变性、退火和复性过程,与待检样本中的未知单链核酸特异性结合,形成可以检测的杂交双链核酸。通过荧光显微镜观察和计数荧光信号,从而检测和诊断染色体或基因异常的细胞和组织样本,为各种基因相关疾病的分类、预测和预后提供准确依据。


临床应用:

        1、荧光原位杂交技术在肿瘤诊断中扮演重要角色,广泛应用于血液肿瘤学和实体肿瘤学,涵盖了乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、肺癌和淋巴癌等实体肿瘤的辅助诊断。目前,FISH主要用于肿瘤的早期诊断、疗效检测、个体化治疗和预后判断等方面。
        2、荧光原位杂交技术在基因定位方面发挥着关键作用,是该技术最基础、最成功的应用之一。目前,荧光原位杂交技术被广泛用于基因的物理定位和基因图谱的绘制。
        3、原位杂交技术在产前检查中发挥关键作用,为产前诊断提供了快捷而可靠的解决方案。通过荧光原位杂交技术,可以在短时间内检测孕妇羊水中的染色体非整倍体,迅速确定胎儿染色体异常疾病。相较于传统方法,这种技术不仅确诊率高达99%,而且缩短了产前诊断的时间,减轻了孕妇的心理负担。


实验原理:

       通过使用已知的标记单链核酸作为探针,根据碱基互补的原则,与待检材料中未知的单链核酸异性结合,形成可检测的杂交双链核酸。由于DNA分子在染色体上呈线性排列,这使得探针能够直接与染色体发生杂交,从而实现特定基因在染色体上的定位。


实验材料准备:

        1、实验用具及材料
            (1)、人的 MyoD1(MYF3)基因探、人外周血中期染色体细胞标本;
            (2)、指甲油、甲酰胺、NaCl 、柠檬  酸  钠、氢氧  化钠、吐温 20 等;
            (3)、恒温水浴锅、培养箱、染色缸、载玻片、Nikon E-400 荧光显微镜、盖玻片、封口膜、200μL移液器、暗盒等。
        2、相关溶液的配制
           (1)20×SSC:175.3 g NaCl,88.2 g 柠檬酸钠,加水至 1 000 mL(用 10 mol/L NaOH调 pH 至 7.0)。
           (2)去离子甲酰胺(DF):将 10 g 混合床离子交换树脂加入 100 mL 甲酰胺中。电磁搅拌 30 min,用 Whatman l 号滤纸滤。
           (3)体积分数 70%甲酰胺/2×SSC:35 mL 甲酰胺,5 mL 20×SSC,10 mL 水。
           (4)体积分数 50%甲酰胺/2×SSC:100 mL 甲酰胺,20 mL 20×SSC,80 mL 水。
           (5)体积分数 50%硫酸葡聚糖(DS):65℃水浴中融化,4℃或-20℃保存。
           (6)杂交液:8 μL 体积分数 25%DS,20 μL 20×SSC 混合。(或 40 μL 体积分数 50% DS,20 μL 20×SSC,40 μL ddH2O 混合)取上述混合液 50 μL,与 5 μL DF 混合即成。其终浓度为体积分数 10% DS,2×SSC,体积分数 50% DF。
           (7)PI/antifade 溶液
             PI 原液:先以双蒸水配置溶液,浓度为 100 μg/mL,取出 1 mL,加 39 mL 双蒸水,使终浓度为 2.5 μg/mL。Antifade 原液:以 PBS 缓冲液配制该溶液,使其浓度为 10 mg/mL,用 0.5 mmol/L 的 NaHCO3 调 pH 值为 8.0。取上述溶液 1 mL,加 9 mL 甘油,混匀。PI/antifade 溶液:PI 与 antifade 原液按体积比 1:9 比例充分混匀,-20℃保存备用。
           (8)DAPI/antifade 溶液:用去离子水配制 1mL/mg DAPI 储存液,按体积比 1:300,以antifade 溶液稀释成工作液。
           (9)封闭液 I:体积分数 5% BSA 3 mL,20×SSC 1 mL,ddH2O 1mL,Tween20 5 μL混合。
          (10)封闭液 II:体积分数 5% BSA 3mL,20×SSC 1mL,goat serum 250 μL,ddH2O 750 μL,Tween20 5 μL 混合。
          (11)荧光检测试剂稀释液:体积分数 5% BSA 1mL,20×SSC 1mL,ddH2O 3mL,Tween20 5μL 混合。
          (12)洗脱液:100 mL 20×SSC,加水至 500 mL,加 Tween20 500 μL。


实验步骤:

         1.、探针变性
               在75℃恒温水浴中,将探针温育5分钟,随后迅速置于0℃,持续5至10分钟,以完成双链DNA探针的变性。
         2.、标本变性
            (1)将准备好的染色体玻片标本放置于50℃的培养箱中烤片2至3小时。(对经Giemsa染色的标本,在烤片前需先在固定液中进行褪色处理)。
            (2)将玻片标本取出,浸泡在70~75℃的70%甲酰胺/2×SSC变性液中,进行2~3分钟的变性处理。
            (3)立即按照顺序将标本在70%、90%和100%体积分数的冰乙醇中进行脱水处理,每个浓度持续5分钟,然后进行空气干燥。
         3、杂交
               取已变性或预退火的DNA探针10μL滴在已变性且脱水的玻片标本上,覆盖18×18盖玻片,用Parafilm密封,放置于37℃的湿暗盒中进行杂交,持续过夜(大约15~17小时)。由于杂交液较少,温度相对较高,而且持续时间较长,为了保持标本的湿润状态,该过程在湿盒中进行。
          4、洗脱
               执行此步骤有助于去除非特异性结合的探针,有效降低背景信号。
              (1) 在杂交的第二天,从37℃温箱中取出标本,轻轻使用刀片揭开盖玻片。
              (2) 将已完成杂交的玻片标本放入预热至42~50℃的50%甲酰胺/2×SSC溶液中,进行3次洗涤,每次5分钟。
              (3) 在已升温至42~50℃的1×SSC中进行3次洗涤,每次5分钟。
              (4) 在室温下,轻轻将玻片标本在2×SSC中漂洗一次。
              (5) 取出玻片,自然干燥。
              (6) 取200μL的复染溶液(可以是PI/antifade或DAPI/antifade染液),滴在玻片标本上,然后盖上盖玻片。
          5、对杂交信号进行放大(适用于使用生物素标记的探针)
              (1) 在玻片的杂交部位加 150 μL 封闭液 I,用保鲜膜覆盖,37℃温育 20min。
              (2) 去掉保鲜膜,再加 150 μL avidin-FITC 于标本上,用保鲜膜覆盖,37℃继续温育 40 min。
              (3) 取出标本,将其放入已预热 42~50℃的洗脱液中洗涤 3 次,每次 5 min。
              (4) 在玻片标本的杂交部位加 150 μL 封闭液 II,覆盖保鲜膜,37℃温育 20 min。
              (5) 去掉保鲜膜,加 150 μL antiavidin 于标本上,覆盖新的保鲜膜,37℃温育 40 min。
              (6) 取出标本,将其放入已预热 42~50℃的新洗脱液中,洗涤 3 次,每次 5 min。
              (7) 重复步骤(1)、(2)、(3),再于 2×SSC 中室温清洗一下。
              (8) 取出玻片,自然干燥。
              (9) 取 200 μL PI/antifade 染液滴加在玻片标本上,盖上盖玻片。
          6、封片
                可以选择使用不同类型的封片液。如果封片液中没有包含Mowiol(这可促使封片产生自封闭效应),为防止盖片与载玻片之间的溶液挥发,可以使用指甲油在盖玻片周围进行封闭。经封闭的玻片标本可在-20℃至-70℃的冰箱中的暗盒内保存数月。
          7.、荧光显微镜观察 FISH 结果
                首先,在可见光源下找到显示细胞分裂相的视野,接着启动荧光激发光源,FITC的激发波长为490 nm。通过PI染色,细胞呈现红色,而由FITC标记的探针位置则发出绿色荧光。


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资料格式:

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